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問題ありません。
そもそもON/OFFのチェックボックスは選択されているオークションと必ずしも連動していません。
複数選択ができますので、ONのものとOFFのものを同時に選択した場合どうするのかという問題がありますので。
「自動入札設定（リスト追加時）」の欄は現在の設定内容を表すものではなく、そこで設定したものを適用ボタンで選択されたオークションに反映させるためのものです。

例えば
１つ目(自動入札ON)を選択 ⇒ チェックボックスはON
２つ目(自動入札OFF)を選択 ⇒ チェックボックスはOFFになる
この状態でチェックボックスを一回クリックしてONにする ⇒ 選択されている二つともONになる
さらにチェックボックスをもう一回クリックしてOFFにする ⇒ 選択されている二つともOFFになる
というような使い方を想定しています。